Ungefär trettio religiösa organisationer finns registrerade hos inrikesministeriets avdelning för religiösa ärenden i Taiwan. Religiösa organisationer kan registrera sig hos de centrala myndigheterna genom deras filialer över hela ön, i enlighet med tempelförvaltningslagen, medborgarorganisationslagen, eller kapitlet i civillagen som styr stiftelser och föreningar. Den 14 mars 2003 förde inrikesministeriet i Taiwan in Scientology-kyrkan i sin förteckning över formellt erkända religiösa organisationer.
”Så snart sökanden anses vara en ny religion måste den inlämna information om sina religiösa lärosatser, syften, skrifter, ritualer och religiösa organisationsstrukturer osv. till ministeriet som underlag. Därför har er organisations ansökan om att uppgraderas till ett nationellt trossamfund beviljats. Härmed accepteras ert samfund som en ny religion.”