I Kroatien ger 2002 års lag om trossamfunds juridiska ställning en generell förklaring av deras ställning och omfattar sådant som statlig finansiering, skatteförmåner och religionsundervisning i skolor. Det är inte obligatoriskt att registrera religiösa grupper. Emellertid beviljas registrerade grupper status som juridisk person och åtnjuter skatteförmåner och annat.
Scientology-kyrkan Kroatien registrerades officiellt som religiös organisation den 22 december 2003 i registret över trossamfund i republiken Kroatien. Justitieministeriet gav inte bara Scientology-kyrkan i Kroatien religiöst erkännande; även religionen Scientology erkändes så att andra religiösa organisationer kan registreras i framtiden.
”SCIENTOLOGY-KYRKAN KROATIEN får godkännande att införas […] i registret över trossamfund i Kroatien.”